Με βάση την υπάρχουσα εμπειρία και τις εφαρμογές στην Ευρωπαϊκή Ένωση, το ΚΑΠΕ εκπονεί μελέτες για την δυνατότητα επενδύσεων και εφαρμογών εναλλακτικών καυσίμων σε οχήματα σε σχέση με την ενεργειακή οικονομική και περιβαλλοντική αποδοτικότητα τους έναντι των συμβατικών, ενώ παρέχει παράλληλα και υπηρεσίες ενημέρωσης και κατάρτισης προς ενδιαφερόμενους φορείς.

Ταυτόχρονα ύστερα από αιτήματα για συνεργασία και παροχή υπηρεσιών από τοπικούς και κρατικούς φορείς καθώς από επαγγελματικές ενώσεις, εκτελεί και μελέτες-έρευνες αγοράς έχοντας ως στόχο την προώθηση της επιβατικής και εμπορευματικής αυτοκίνησης σε επίπεδο υποδομών και στόλων οχημάτων με φιλικά προς το περιβάλλον εναλλακτικά καύσιμα (π.χ ηλεκτρισμός, βιοκαύσιμα, φυσικού αεριού ,υδρογόνου) και οχημάτων εναλλακτικής τεχνολογίας (υβριδικών, ηλεκτρικών/ηλεκτρικών υβριδικών, κυψελίδων καυσίμου κλπ.).