Το Τμήμα υλοποιεί έργα έρευνας και ανάπτυξης στο τομέα της βιοενέργειας ενώ οι ειδικότερες δραστηριότητές του περιλαμβάνουν την ανάπτυξη, μελέτη και αξιολόγηση ενεργειακών και άλλων μη-τροφικών καλλιεργειών, την εκτίμηση διαθεσιμότητας και ενεργειακού περιεχομένου ενός ευρέος φάσματος πρώτων υλών βιομάζας (γεωργικών/δασικών υπολειμμάτων και υποπροϊόντων καθώς και υπολειμμάτων των γεωργικών και δασικών βιομηχανιών και κτηνοτροφικών μονάδων), καθώς και την έρευνα, ανάπτυξη και χρησιμοποίηση τεχνολογιών αεριοποίησης της βιομάζας.
Επιπλέον, δραστηριοποιείται στη διενέργεια μελετών σκοπιμότητας και ανάπτυξης δικτύων διαχείρισης βιομάζας για διάφορες ενεργειακές χρήσεις (παραγωγή στερεής βιομάζας, τηλεθέρμανση, συμπαραγωγή, βιοαέριο, βιομεθάνιο, βιοκαύσιμα).
Ιδιαίτερη έμφαση δίνεται επίσης στη διάδοση και υλοποίηση σχημάτων διακίνησης και εμπορίου βιομάζας και ενεργειακών υπηρεσιών που βασίζονται στη χρήση βιομάζας, καθώς και στη διάδοση και εφαρμογή τεχνικών προδιαγραφών και προτύπων που αφορούν τη βιομάζα και τα παραγόμενα από αυτή καύσιμα.
